巨菌草种植放牧、养菇以及生产工业原料等是巨菌草近年来的投资热门项目。菌草技术的应用与发展为国家农林以及工业发展、生态环境治理带来新的希望。随着菌草技术的不断深入研究，国家菌草技术发明人林占熺教授和他的团队在菌草生长过程中发现了大量的内生固氮菌，这一新发现无疑为菌草成为新型的固氮菌生物肥料提供理论基础和依据。

　　植物的内生固氮菌是指与植物共生的情况下能够产生氮源的寄生生物。例如寄生在豆科植物根部的根瘤菌，当土壤中有豆科植物生长时，根瘤菌迅速向它根部靠拢，从根毛弯曲处进入根部。豆科植物根部在根瘤菌的刺激下迅速分裂膨大，形成“瘤子”，为根瘤菌提供了理想的活动场所，还供应了丰富的养料，让根瘤菌生长繁殖。同时根瘤菌又会卖力的从空气中吸收氮气 ，为豆科植物制作氮肥，使其枝繁叶茂。豆科植物与根瘤菌两者形成互利共生的关系。通常情况下，含体内存在互利共生的固氮菌植物种类较少，而且存在的固氮菌种类较为单一。不过在巨菌草的根茎叶中分离出克雷伯氏菌属、草螺菌属和慢生根瘤菌属的三种主演的固氮菌，均为变形菌门。其中克雷伯氏菌固氮菌固定化后具有良好的实际应用价值，可为将来以其开发新型的固氮菌生物肥料。

　　固氮菌的生长离不开寄生的植株，与此同时固氮菌给植株根茎叶创造了充足的氮肥。巨菌草种植简单，抗逆性强，盐碱地也可以种植。生长速度快，根系十分发达，根部的内生固氮菌产生的氮肥不仅可以供应巨菌草的生长需求，还可以储存在土壤中留给“晚辈”。因此大面积种植可以利用其体内寄生的固氮菌起到改量土壤的作用，增加土壤的含氮量。

　　现在生产氮肥的方法，不仅浪费大量原料，而且需要高压高温控制等苛刻条件提取，生产成本投入很大，生产的氮肥氨分子利用率也非常低。相信在不久的将来，人们将会利用巨菌草高产量，易种植等特点，直接从巨菌草的根茎叶提取大量的固氮菌，制作生物固氮菌肥料，这样生产的生物氮肥不仅大大节约了氮肥生产成本，而且产生的氮肥不会对环境造成污染，植物的吸收利用率更高。